经多年的探索，中国大气本底基准观象台建立了完整的管理体系和运行模式，在仪器架设布局、维护保养、样品采样、标准气体的配制、数据质量控制、档案气的存放以及仪器巡视、值班记录填写、交接班等各环节，建立了严格的技术标准和操作流程，实现规范化和标准化。

与此同时，不断完善基础设施，建成了7公里长的自备盘山公路，架设了两路80公里长的供电线，开通了有线电话和宽带网等，并进行了环境的整治和美化。中国大气本底基准观象台远离城镇，社会依托十分薄弱，安全生产十分重要，我们制定了《瓦里关山基地安全检查制度》、《本底台消防安全管理规定》等严格的安全制度，致力于将安全隐患杜绝在萌芽时期。

图为储存的档案气

为了保证监测环境的数据的准确可靠，采取各种措施，最大限度地控制自身产生的人为污染，架设专用管道将室内空气排放到200米以外的山下；生活垃圾定期回收定点填埋；实验室保持恒温恒湿；环境的变化状况和监测区人类活动等进行备注纪录，通过这些一系列有效措施，保证了监测数据的准确和可靠。

为了保证观测数据质量，建站伊始建立了严格的环境保护，通过地方立法，设立4000多平方公里的保护区，规定保护区内严禁开矿、兴建大型排放企业等。2010年，玉树航线即将开通，民航部门以大局为重，特意改变航班飞过测站上空的计划，绕道飞行。